تعتبر بذور الكتان مصدراً جيداً للألياف الغذائية وأحماض أوميغا 3، ولها العديد من الفوائد الصحية، أبرزها المساهمة في تخسيس البطن وخسارة الوزن، وتوفير الإحساس بالشبع بفضل الألياف الموجودة فيها، كما تعمل على خفض مستوى السكر والكولسترول في الدم، وتلعب دوراً كبيراً في تمييع الدم وخفض تخثره وتقليل خطر الإصابة بتصلب الشرايين.

تناول بذور الكتان يُساهم في محاربة السرطان بفضل مركبات الليجنان الشبيهة بهرمون الاستروجين، وتحسين اضطراب المناعة الذاتية، أو اضطراب الذئبة الحمراء، كما تقلل أعراض التهابات المسالك البولية وتساعد في علاج الإمساك واضطرابات المعدة.